Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Klf3Q60980 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms