Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CttnQ60598 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CttnQ60598 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CttnQ60598 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CttnQ60598 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms