Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vps41Q5KU39 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vps41Q5KU39 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms