Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm3558Q5FWC9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3558Q5FWC9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3558Q5FWC9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3558Q5FWC9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm3558Q5FWC9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3558Q5FWC9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3558Q5FWC9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm3558Q5FWC9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3558Q5FWC9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3558Q5FWC9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3558Q5FWC9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3558Q5FWC9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3558Q5FWC9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm3558Q5FWC9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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