Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc160Q3UYG1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc160Q3UYG1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms