Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vwa5b2Q3UR50 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vwa5b2Q3UR50 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms