Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc34Q3UI66 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms