Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pitpnm3Q3UHE1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms