Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hddc2Q3SXD3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms