Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fgfbp3Q1HCM0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fgfbp3Q1HCM0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fgfbp3Q1HCM0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fgfbp3Q1HCM0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fgfbp3Q1HCM0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fgfbp3Q1HCM0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fgfbp3Q1HCM0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fgfbp3Q1HCM0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fgfbp3Q1HCM0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fgfbp3Q1HCM0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fgfbp3Q1HCM0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fgfbp3Q1HCM0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Fgfbp3Q1HCM0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fgfbp3Q1HCM0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fgfbp3Q1HCM0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fgfbp3Q1HCM0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fgfbp3Q1HCM0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fgfbp3Q1HCM0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms