Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CACNB2Q08289 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNB2Q08289 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms