Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox4Q06831 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms