Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1Q04750 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1Q04750 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top1Q04750 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Top1Q04750 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms