Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rbp1Q00915 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp1Q00915 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms