Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Itga4Q00651 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms