Protein–RNA interactions for Protein: P63011

Rab3a, Ras-related protein Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3aP63011 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab3aP63011 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab3aP63011 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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