Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TdgP56581 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TdgP56581 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TdgP56581 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TdgP56581 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TdgP56581 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TdgP56581 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TdgP56581 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TdgP56581 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TdgP56581 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TdgP56581 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TdgP56581 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TdgP56581 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TdgP56581 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TdgP56581 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TdgP56581 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TdgP56581 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TdgP56581 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TdgP56581 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TdgP56581 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TdgP56581 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TdgP56581 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TdgP56581 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TdgP56581 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TdgP56581 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TdgP56581 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TdgP56581 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TdgP56581 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TdgP56581 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TdgP56581 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TdgP56581 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TdgP56581 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TdgP56581 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TdgP56581 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TdgP56581 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TdgP56581 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TdgP56581 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TdgP56581 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms