Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rad23aP54726 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms