Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csn1s1P19228 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csn1s1P19228 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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Csn1s1P19228 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Csn1s1P19228 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Csn1s1P19228 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Csn1s1P19228 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Csn1s1P19228 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Csn1s1P19228 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Csn1s1P19228 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Csn1s1P19228 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Csn1s1P19228 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Csn1s1P19228 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Csn1s1P19228 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Csn1s1P19228 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Csn1s1P19228 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Csn1s1P19228 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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