Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Defa1P11477 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms