Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06336 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06336 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06336 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06336 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06336 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06336 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P06336 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06336 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06336 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06336 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06336 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06336 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06336 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06336 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06336 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06336 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06336 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06336 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P06336 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P06336 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P06336 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
P06336 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06336 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P06336 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06336 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06336 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06336 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06336 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06336 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P06336 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06336 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06336 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06336 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06336 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06336 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06336 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06336 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P06336 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06336 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06336 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06336 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06336 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06336 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06336 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06336 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06336 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P06336 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms