Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01673 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01673 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01673 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01673 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms