Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sp100O35892 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp100O35892 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp100O35892 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sp100O35892 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms