Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sema6aO35464 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms