Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xbp1O35426 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms