Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Dgcr6O35347 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Dgcr6O35347 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Dgcr6O35347 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Dgcr6O35347 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Dgcr6O35347 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Dgcr6O35347 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Dgcr6O35347 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Dgcr6O35347 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Dgcr6O35347 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Dgcr6O35347 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Dgcr6O35347 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Dgcr6O35347 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Dgcr6O35347 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Dgcr6O35347 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Dgcr6O35347 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Dgcr6O35347 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dgcr6O35347 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms