Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21310J3QQ23 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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