Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

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Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Gm19965J3QNY8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm19965J3QNY8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm19965J3QNY8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm19965J3QNY8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm19965J3QNY8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gm19965J3QNY8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm19965J3QNY8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gm19965J3QNY8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm19965J3QNY8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm19965J3QNY8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gm19965J3QNY8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm19965J3QNY8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm19965J3QNY8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm19965J3QNY8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm19965J3QNY8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm19965J3QNY8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm19965J3QNY8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm19965J3QNY8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm19965J3QNY8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm19965J3QNY8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm19965J3QNY8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm19965J3QNY8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm19965J3QNY8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm19965J3QNY8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm19965J3QNY8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm19965J3QNY8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm19965J3QNY8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm19965J3QNY8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm19965J3QNY8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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