Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Zfp988F6VKC7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Zfp988F6VKC7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Zfp988F6VKC7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Zfp988F6VKC7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Zfp988F6VKC7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Zfp988F6VKC7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zfp988F6VKC7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zfp988F6VKC7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zfp988F6VKC7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Zfp988F6VKC7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Zfp988F6VKC7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Zfp988F6VKC7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Zfp988F6VKC7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms