Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc144bE9PVZ3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms