Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pramef6A2A8M8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pramef6A2A8M8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pramef6A2A8M8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pramef6A2A8M8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pramef6A2A8M8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Pramef6A2A8M8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pramef6A2A8M8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pramef6A2A8M8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pramef6A2A8M8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Pramef6A2A8M8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramef6A2A8M8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Pramef6A2A8M8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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