Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAX2Q9UIW0 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms