Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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