Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
FAM187BQ17R55 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms