Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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