Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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RAB39AQ14964 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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RAB39AQ14964 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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RAB39AQ14964 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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RAB39AQ14964 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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RAB39AQ14964 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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RAB39AQ14964 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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RAB39AQ14964 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
RAB39AQ14964 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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