Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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