Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCIRG1Q13488 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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