Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CHAF1AQ13111 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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CHAF1AQ13111 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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CHAF1AQ13111 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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CHAF1AQ13111 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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CHAF1AQ13111 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHAF1AQ13111 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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