Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CENPFP49454 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CENPFP49454 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CENPFP49454 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms