Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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HOXD10P28358 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
HOXD10P28358 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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