Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms