Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms