Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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VAMP3Q15836 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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VAMP3Q15836 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 PAGE4-201ENST00000218068 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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VAMP3Q15836 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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VAMP3Q15836 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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VAMP3Q15836 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
VAMP3Q15836 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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