Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CD109-202ENST00000422508 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ARNTL2-207ENST00000542388 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC005831.1-201ENST00000624384 1697 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 DNAH11-201ENST00000328843 13917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 TBC1D30-204ENST00000542120 7433 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
HERC1Q15751 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms