Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
JMJD1CQ15652 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms