Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms