Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTCH1Q13635 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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