Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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LINC00587B1AMM8 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LINC00587B1AMM8 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
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