Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms